Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM1B2RUZ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms