Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms