Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCO5BA8MYB1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms