Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A8MVJ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A8MVJ9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A8MVJ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms