Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SFI1A8K8P3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFI1A8K8P3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms