Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P2A8K0S8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIS3P2A8K0S8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms