Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF233A6NK53 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF233A6NK53 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms