Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms