Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0J9YVX5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0J9YVX5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms