Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MIR3911-201ENST00000577791 109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC068473.2-201ENST00000587315 474 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 SMCO4P1-201ENST00000592909 177 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC020907.4-201ENST00000605640 526 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC005618.1-202ENST00000606674 544 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC253536.6-201ENST00000609736 663 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 SSX3-204ENST00000612497 1030 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 OR4K14-202ENST00000641793 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 LILRB4-204ENST00000391736 4002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ADGRG1-255ENST00000567835 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 FCN1-202ENST00000616356 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ZNF232-208ENST00000575898 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL132655.3-201ENST00000603095 1619 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 NAV2-201ENST00000349880 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 GPR156-203ENST00000464295 4442 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RPGR-201ENST00000318842 3108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CNR1-205ENST00000468898 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ZNF610-203ENST00000403906 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 NDUFS1-209ENST00000457011 2171 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC090616.7-201ENST00000625123 2179 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC117529.1-201ENST00000505789 2023 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL137025.1-201ENST00000436932 2378 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 MAPK10-386ENST00000642038 2354 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 PDPN-212ENST00000621990 2738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 IL7-202ENST00000379113 1888 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 GRM1-207ENST00000507907 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ZNF620-201ENST00000314529 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ZNF415-202ENST00000421033 2402 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 LINC01761-201ENST00000424943 2755 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RRP12-201ENST00000315563 4038 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 HPSE2-203ENST00000370552 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC012085.2-201ENST00000550287 1587 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 MAGEB4-201ENST00000378982 2142 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CEP41-217ENST00000541543 6222 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 C1orf74-201ENST00000294811 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC01184-203ENST00000501652 1601 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DCTN6-201ENST00000221114 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 C20orf173-201ENST00000246199 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OR10H4-201ENST00000322107 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SLPI-201ENST00000338380 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AL121910.1-201ENST00000420710 500 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 MIR4435-2HG-212ENST00000444301 666 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 C20orf173-204ENST00000444723 1059 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC073288.2-201ENST00000468232 664 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC003029.1-201ENST00000493495 603 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TMEM92-202ENST00000507382 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC116359.1-201ENST00000510731 1099 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 DCTN6-203ENST00000520829 880 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC022679.1-201ENST00000522559 496 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SSPN-207ENST00000540266 587 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC007749.1-201ENST00000564299 585 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC092139.1-201ENST00000567149 497 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TMEM170A-204ENST00000567796 734 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL531P-201ENST00000578464 282 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 RN7SL387P-201ENST00000581015 273 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-12-202ENST00000618832 282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TOGARAM1-202ENST00000361577 6247 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ACSL6-202ENST00000357096 6298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF2-202ENST00000611463 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NIP7-202ENST00000254941 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 LINC00243-201ENST00000399196 2052 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 WDR93-205ENST00000560294 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF30-204ENST00000601142 2280 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CCL28-203ENST00000513525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TACC2-203ENST00000358010 3815 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SLC8A1-202ENST00000402441 3065 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF385B-203ENST00000409692 2109 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AP3B2-215ENST00000620652 3729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC007938.4-201ENST00000610046 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SCMH1-211ENST00000456518 1586 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC108704.2-201ENST00000623017 1565 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 AC100827.3-201ENST00000566291 2155 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TMEM161B-201ENST00000296595 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 UGT1A1-202ENST00000360418 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 NF1P9-201ENST00000629326 2008 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 TUBB1-201ENST00000217133 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF780A-206ENST00000595687 3472 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 EDNRA-201ENST00000324300 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 PDE4D-207ENST00000405755 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 ZNF649-207ENST00000600738 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 OPTN-205ENST00000378757 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LMO3Q8TAP4 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms