Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 DDR2-201ENST00000367921 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 COL5A2-201ENST00000374866 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 EDNRB-201ENST00000334286 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 LINC01539-201ENST00000587904 2068 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 DNAAF4-204ENST00000457155 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 SLC30A8-202ENST00000456015 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 MADD-205ENST00000395344 4988 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 HMGCLL1-206ENST00000428842 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AR-201ENST00000374690 10652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 WBP11P1-202ENST00000567636 2972 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RSPH4A-203ENST00000368581 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 TNIP3-203ENST00000507879 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC120036.5-201ENST00000528139 2491 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 PLAG1-202ENST00000423799 1684 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 FCGR3A-202ENST00000367969 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 TCF4-208ENST00000543082 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ZFYVE1-208ENST00000556143 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-210ENST00000399606 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-216ENST00000399638 6595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 NPHP1-207ENST00000445609 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 SGO1-206ENST00000421451 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 DMRTC1B-201ENST00000334036 1197 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RNA5SP174-201ENST00000362702 118 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RNA5SP304-201ENST00000411199 104 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 PRYP1-201ENST00000412474 445 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 PRYP2-201ENST00000416652 492 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 OR8B1P-201ENST00000419328 918 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC068279.1-201ENST00000444323 888 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL662795.1-201ENST00000448756 634 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL662791.2-201ENST00000455287 596 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RN7SL865P-201ENST00000466711 289 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RN7SL446P-201ENST00000476053 296 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL133368.1-201ENST00000486273 814 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 DPH3P1-201ENST00000486648 249 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC109927.1-203ENST00000507038 421 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC103982.1-201ENST00000561358 571 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 TMSB15B-206ENST00000569577 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC104532.2-201ENST00000591109 589 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC005339.1-201ENST00000598070 392 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RN7SL462P-201ENST00000610302 261 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RN7SL422P-201ENST00000612850 261 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RN7SL343P-201ENST00000620904 261 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RN7SL640P-201ENST00000622591 261 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 TIMP2-202ENST00000536189 3415 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 KCNJ15-208ENST00000398938 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CAMSAP2-203ENST00000413307 4498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 C15orf53-201ENST00000318792 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AKR1D1-201ENST00000242375 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 LINC01514-201ENST00000434189 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CLUHP4-201ENST00000507604 1343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 Z83847.1-201ENST00000569912 1463 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 Z99289.2-201ENST00000603682 1931 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL445309.1-201ENST00000607565 1989 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RFX3-201ENST00000302303 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL158071.4-201ENST00000608358 4125 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 FBXL7-201ENST00000329673 3960 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CKMT2-AS1-202ENST00000501927 2463 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 DCTN4-202ENST00000446090 1737 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 GRAMD1B-206ENST00000529432 6266 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC016526.3-201ENST00000624275 3931 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ADCY10P1-202ENST00000457653 3785 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CDHR1-206ENST00000623527 6781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 CASP8-201ENST00000264274 2540 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 MCTS1-201ENST00000371315 1130 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 IGLV5-45-201ENST00000390296 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RNA5SP207-201ENST00000390874 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 PHKA1P1-201ENST00000420457 621 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 Z98048.1-201ENST00000424746 491 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL355990.2-201ENST00000440688 508 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 COX17-206ENST00000497116 660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RN7SL167P-201ENST00000498381 302 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 C5orf64-AS1-201ENST00000506550 1265 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 PRPS1L1-201ENST00000506618 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 IGHV7-27-201ENST00000522512 330 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LMO3Q8TAP4 AL136418.1-201ENST00000551799 975 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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