Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
V9GYQ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
V9GYQ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
V9GYQ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
V9GYQ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
V9GYQ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms