Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A3GALT2U3KPV4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms