Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC9Q9Y397 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC9Q9Y397 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms