Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM2AQ9Y2K7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM2AQ9Y2K7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms