Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms