Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms