Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms