Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZRN3Q9UPQ7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN3Q9UPQ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms