Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS4AQ9UN37 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPS4AQ9UN37 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms