Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms