Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNMA2Q9UL42 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA2Q9UL42 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms