Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSPAN16Q9UKR8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN16Q9UKR8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms