Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERG28Q9UKR5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERG28Q9UKR5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERG28Q9UKR5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms