Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CROTQ9UKG9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CROTQ9UKG9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms