Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms