Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT7Q9UIV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT7Q9UIV1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms