Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP25Q9UHP3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP25Q9UHP3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms