Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms