Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms