Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NPC1L1Q9UHC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NPC1L1Q9UHC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms