Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VTI1BQ9UEU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms