Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM10Q9UDY6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms