Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms