Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DKK4Q9UBT3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms