Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms