Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms