Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CC2D2AQ9P2K1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms