Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD2Q9NZR1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMOD2Q9NZR1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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