Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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