Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNHIT6Q9NWK9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT6Q9NWK9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms