Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT57Q9NWB7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFT57Q9NWB7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFT57Q9NWB7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT57Q9NWB7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFT57Q9NWB7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms