Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBRD1Q9NUN5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms