Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC39A9Q9NUM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms