Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT82Q9NSB4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms