Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELLSQ9NRZ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms