Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS45Q9NRW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS45Q9NRW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms