Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms