Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN4Q9NQC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms