Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms